Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp11Q8CB67 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrp11Q8CB67 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp11Q8CB67 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp11Q8CB67 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms