Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A430089I19RikQ8C9W1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A430089I19RikQ8C9W1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms