Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CrbnQ8C7D2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CrbnQ8C7D2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms