Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp20Q8C6M1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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