Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc90bQ8C3X2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms