Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc21aQ8C0S4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21aQ8C0S4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21aQ8C0S4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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