Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm4aQ8BW72 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm4aQ8BW72 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm4aQ8BW72 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms