Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY2

Slc4a7, Sodium bicarbonate cotransporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a7Q8BTY2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc4a7Q8BTY2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a7Q8BTY2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc4a7Q8BTY2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms