Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cep55Q8BT07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep55Q8BT07 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms