Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR90

UPF0600 protein C5orf51 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BR90 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BR90 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8BR90 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8BR90 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8BR90 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8BR90 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8BR90 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8BR90 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8BR90 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BR90 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BR90 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BR90 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BR90 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BR90 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BR90 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BR90 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BR90 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BR90 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BR90 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BR90 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BR90 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BR90 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms