Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
5730596B20RikQ8BQ08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms