Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hirip3Q8BLH7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hirip3Q8BLH7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms