Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubash3bQ8BGG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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