Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htatsf1Q8BGC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htatsf1Q8BGC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms