Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm2Q8BGA3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms