Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pknox2Q8BG99 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms