Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2bQ8BG39 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sv2bQ8BG39 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sv2bQ8BG39 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms