Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pld4Q8BG07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pld4Q8BG07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pld4Q8BG07 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pld4Q8BG07 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms