Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo1Q8BFY9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms