Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd4Q8BFT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd4Q8BFT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms