Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg4cQ811C2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg4cQ811C2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4cQ811C2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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