Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc50Q810U5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc50Q810U5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms