Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfascQ810U3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms