Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmes1Q810Q5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nmes1Q810Q5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms