Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim19Q80ZU4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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