Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Amigo1Q80ZD8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Amigo1Q80ZD8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms