Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkhd1l1Q80ZA4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkhd1l1Q80ZA4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkhd1l1Q80ZA4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkhd1l1Q80ZA4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pkhd1l1Q80ZA4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms