Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnnQ80Z71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
TnnQ80Z71 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TnnQ80Z71 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms