Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ClspnQ80YR7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ClspnQ80YR7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ClspnQ80YR7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ClspnQ80YR7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ClspnQ80YR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ClspnQ80YR7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ClspnQ80YR7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ClspnQ80YR7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms