Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp8Q80YR6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp8Q80YR6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms