Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbed4Q80WQ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbed4Q80WQ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms