Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ell3Q80VR2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ell3Q80VR2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms