Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Avl9Q80U56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Avl9Q80U56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms