Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
NischQ80TM9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NischQ80TM9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
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