Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atf7ipQ7TT18 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atf7ipQ7TT18 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms