Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lamp3Q7TST5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lamp3Q7TST5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms