Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClmQ7TSN2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClmQ7TSN2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms