Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdp1Q7TSG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctdp1Q7TSG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms