Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc2aQ7TSC1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2aQ7TSC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms