Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ckap2lQ7TS74 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms