Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfsf18Q7TS55 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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