Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc93Q7TQK5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc93Q7TQK5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc93Q7TQK5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms