Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ShprhQ7TPQ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ShprhQ7TPQ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ShprhQ7TPQ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms