Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno2Q7TNB8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sbno2Q7TNB8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno2Q7TNB8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno2Q7TNB8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sbno2Q7TNB8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms