Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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Shq1Q7TMX5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
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Shq1Q7TMX5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Shq1Q7TMX5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Shq1Q7TMX5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Shq1Q7TMX5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Shq1Q7TMX5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Shq1Q7TMX5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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Shq1Q7TMX5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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Shq1Q7TMX5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Shq1Q7TMX5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shq1Q7TMX5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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