Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyfip1Q7TMB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyfip1Q7TMB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms