Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znrd1Q791N7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms