Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vma21Q78T54 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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