Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sys1Q78S06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sys1Q78S06 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms