Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rph3alQ768S4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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